August 05, 2016

B
iểu đồ tương quan hai hay nhiều biến mô tả mối tương quan giữa hai hay nhiều biến liên tục của đối tượng điều tra. Trong phạm vi bài này, tôi tập tành một chút và giới thiệu thành quả về 2 loại biểu đồ: (a) biểu đồ tương quan giữa 2 biến và (b) biểu đồ tương quan đa biến.

  • Biểu đồ tương quan giữa 2 biến

Ví dụ: trong công trình nghiên cứu về các chỉ tiêu sinh trưởng của cây Keo tai tượng ở các địa phương (miền núi phía Bắc) ở các độ tuổi khác nhau, từ tuổi 2 đến tuổi 8. Vấn đề đặt ra, tìm hiểu mối tương quan giữa: (i) đường kính ngang ngực và chiều cao cây; (ii) trữ lượng và đường kính ngang ngực; (iii) độ tuổi và trữ lượng;...
Trong R có thể dùng hàm plot (y ~ x, ...) để tìm hiểu mối tương quan giữa các biến trên (tương quan 2 biến).
Với data (rt2n) gồm các biến sau:
> names(rt2n)
 [1] "age"             "diameter"        "tree_height"     "del_diameter"  
 [5] "del_tree_height" "g"               "delg"            "m"             
 [9] "delm"            "do_cao"        
> 
# Tìm hiểu mối tương quan giữa trữ lượng với đường kính ngang ngực cây Keo tai tượng ở các độ tuổi khác nhau. Dùng lệnh plot (data, y~x, ...) dưới đây:

> plot(data=rt2n, m~diameter, pch=16, xlab="diameter, cm", ylab="M, m3", main="Figure 1", color="green")

# reslt Figure 1
# Tìm hiểu mối tương quan giữa trữ lượng với chiều cao cây cây Keo tai tượng ở các độ tuổi khác nhau. Dùng lệnh plot (data, y~x, ...) dưới đây:

> plot(data=rt2n, m~tree_height, pch=16, xlab="tree_height, m", ylab="M, m3", main="Figure 2", col="red")
# reslt Figure 2
# Tương tự, dùng hàm plot (data, y~x, ...) cho các biến khác.
# Note: Tuy nhiên, các biểu đồ trên chúng ta chỉ có thể mô tả được 2 biến. Vì vậy, để mô tả biểu đồ tương quan của nhiều biến cùng một lúc (với data (rt2n có thể thể hiện 10 biến liên tục cùng một lúc). Để làm được điều này, chúng ta có thể dùng hàm pairs.panels trong package “psych” trong R. Cụ thể dưới đây.

  • Biểu đồ tương quan đa biến

> library(psych)
Chúng ta có thể dùng lệnh pairs để mô tả tương quan giữa các biến như sau:
> pairs(rt2n, pch=16,col="blue", main="Figure 3")
# reslt Figure 3
Tuy nhiên, biểu đồ trên mới cho cái nhìn tổng quát phân bố giữa các biến, mà chưa nói lên mối tương quan thông qua con số cụ thể (R). Để làm được điều này, chúng ta có thể dùng lệnh sau:
> pairs(rt2n, lower.panel=panel.smooth, upper.panel=matrix.cor, main="Figure 4")
# reslt Figure 4
# Hoặc dùng hàm pairs.panels in package (psych) như lúc đầu có đề cập. Cụ thể như sau:
> pairs.panels(rt2n, main="Figure 5")
# reslt Figure 5
Diễn giải kết quả, đồ thị này (Figure 5) cho chúng ta biết tất cả hệ số tương quan giữa tất cả các biến số (biến liên tục). Cụ thể như, hệ số tương quan cao nhất (0.98) giữa trữ lượng (m) với đường kính ngang ngực (diameter); giữa m và g (0.95);... là những mối tương quan có hệ số cao nhất (có ý nghĩa thống kê). Tuy nhiên, giữa do_cao và del_diameter; do_cao và del_tree_height;... có hệ số tương quan quá thấp và không có ý nghĩa thống kê. Ngoài ra, đồ thị trên còn cung cấp cho ta biểu đồ tán xạ, biểu đồ histogram cho từng cặp biến số và cho biết, hệ số tương quan càng cao, kích thước của font chữ (số) càng lớn.

=====================================================================
Tham khảo: Nguyễn Văn Tuấn

0 comments:

chủ đề

Ăn của rừng bài báo khoa học bản quyền bành trướng Bảo vệ cây là bảo vệ chính mình biến đổi khí hậu Biển Đông Biết sai vẫn cứ làm biểu đồ biểu đồ hộp biểu đồ sai số chuẩn Biểu đồ tương quan Biểu đồ với nhãn bon-sai boxplot buoc-dau-nghien-cuu-khoa-hoc but-ky-doi-toi Cái tài Cái tâm Cái tầm canh tác đất dốc Cây xanh đô thị Cha chung không ai khóc cha nào con nấy Chân thiện mỹ chân trong chân ngoài chạy chức chạy quyền Che chở Chết toàn tập chọn cách ta sống chữ tín chuyện giờ mới kể có vấn đề Cơm áo gạo tiền Con cháu các cụ con người biến thái Con ông cháu cha công nghệ 4.0 correlation matrix corrgram corrplot Cứ đi rồi sẽ tới cuộc cách mạng 4.0 Đam mê đàn gảy tai trâu danh dự danh xưng phù phiếm Đạo đức sống đào tạo sau đại học Đạo văn Đấu tranh sinh tồn day-do Đẹp trong tâm hồn Đi tắt đón đầu dở khóc dở cười đọc nghe nhìn và cảm nhận Dồn điền đổi thửa Động lực dựa vào nhau mà sống error bar plot GGalyy ggcorplot ggExtra ggiraph ggplot2 ggrepel ggthemes Giáng sinh Giáo dục giàu nghèo giục tốc bất đạt Góc quê gridExtra Hài lòng Hai mặt một lời hãy là chính mình hãy sống có trách nhiệm hơn hèn nhát Hiệu sau ứng bão hiệu ứng domino formosa Hiệu ứng sau bão Hòa cả làng học giả bằng thật hoc-lam-tho hoc-r-moi-ngay Ích kỷ KH&CN khả năng Khoán chi Không lối thoát Kiểm định thống kê kỹ năng mềm Kỷ niệm vùng miền Label lan rừng Lão Hạc thế kỷ 21 Liêm chính lính đánh thuê Lợi dụng lợi ích nhóm lừa trên gạt dưới lười suy nghĩ Lương thiện giả vờ Lương y Ma trận tương quan Mẹ Miền cát trắng miền đất hứa Mộc Châu món ăn địa phương Mùa gặt Mục đích sống Mường La Nghịch lý chất lượng - số lượng Nghiên cứu khoa học Ngồi chơi xơi nước Nhân cách nhu cầu Những cung đường tôi đã qua NN&PTNT phân cấp sinh trưởng phân tích hậu định phan-bien-xa-hoi plot3D psych Quán Nha R Rừng ngập mặn rước hổ về nhà rvg sach-hay SARS-CoV-2 sau-luy-tre-lang sciplot Số cây Số liệu trống không Sông Châu sống chết mặc ai sức ỳ sức ỳ bản thân suy thoái Tầm lùn tâm sự tâm sự buồn thảm họa formosa thảm họa môi trường tham nhũng Thân cô thế cô thắng cố ngựa Thăng trầm Thấy vậy mà không phải vậy Thế cây Thế cây cổ Thế cây thế người Thông điệp cuộc đời Thống kê mô tả Thông tư Thước đo lòng người Thủy điện Tiên trách kỷ hậu trách nhân Tình bạn cao đẹp Tình người Tố chất làm khoa học tội đếch gì mà phải ghét ai Tôi sợ giầu lắm track changes Trải nghiệm tre già măng mọc trở mặt Trung thực tư duy Tự sự Tư tưởng thụt lùi tuy duy nhiệm kỳ Ứng dụng R trong lâm nghiệp Văn hóa cảm ơn Văn hóa giao thông văn hóa ngầm Văn hóa xin lỗi Xấu khen đẹp chê Xỏ nhầm giầy xoay đầu đổi đít Ý tưởng

bài đã đăng

Powered by Blogger.

Disqus Shortname

Widget Recent Post No.

Widget Random Post No.

Widget Recent Comment No.

PageNavi Results No.

Labels Max-Results No.

Comments system

Contact Form

Name

Email *

Message *

bài đăng phổ biến

số lượt ghé qua trang blog

Bài đăng nổi bật

Thế cây thế người

T hế trong CÂY CẢNH thể hiện các chi tiết về CẤU TRÚC ở mọi phương diện, đa góc nhìn (trên dưới trái phải ngang dọc), trong đ...

Bài đăng phổ biến

bài xem nhiều nhất