July 30, 2016

T
rong phạm vi bài này, mình mới biết thêm và tập tành việc kết hợp package gggplot2 với package rvg and package ggiraph để tạo nên những biểu đồ đẹp, bắt mắt và quan trọng hơn cả là logic, khoa học hơn có thể. Như vậy, cho thấy ggplot2 có thể kết hợp với nhiều packages khác giúp làm đẹp hơn cho các biểu đồ mà mình mong muốn. Hãy thử tập tành chút với 04 packages (ggplot2, ggthemes, rvg and ggiraph) dưới đây. Tuy nhiên, để cảm nhận được sự khác biệt khi kết hợp ggplot2 với các gói khác thì việc dùng những cụm từ khó mà có thể diễn tả hết được. Vì vậy, nếu ai đó quan tâm nên thử để cảm nhận sự khác biệt đó.

Ví dụ dưới đây mình sẽ nói cụ thể từng layer ở mỗi packages khác nhau để kết hợp với gói ggplot 2 để vẽ biểu đồ. Như các bài trước mình đã kết hợp các layer giữa ggplot2 với gridExtra, giữa ggplot2 với ggthemes, hoặc giữa ggplot2 với ggthemes và gridExtra... ở bài này là sự hòa quyện giữa 04 packages để tạo nên một biểu đồ tương đối hoàn chỉnh. Xin được dùng từ tương đối thôi, bởi ggplot2 có thể kết hợp nhiều hơn nữa các gói khác để tạo nên những biểu đồ đẹp hơn, lung linh hơn và quan trọng hơn cả là KHOA HỌC.

Dưới dây là các layer ở mỗi gói khác nhau để kết hợp với ggplot2 là chủ đạo, cụ thể:
#data=rt2
#library (ggplot2)
#library (ggthemes)
#library (rvg)
#library (ggiraph)

#package (ggthemes)
# geom_rangeframe()+ theme_tufte()+scale_x_continuous(breaks=extended_range_breaks()(data$x))+scale_y_continuous(breaks=extended_range_breaks()(data$y))

#package (rvg)
#geom_point_interactive(aes(tooltip=..., data_id=...), size=...)

#package (ggiraph)
ggiraph(code=print(datanew), width=...)

Riêng việc kết hợp với ggiraph sẽ tạo ra link biểu đồ ngay trong ổ C của máy tính cá nhân. Từ đó biểu đồ đó, ta di chuột đến bất cứ điểm nào (dot) trên biểu đồ sẽ cho thông tin về điểm đó (trong ví dụ là chỉ số đường kính, chiều cao, tiết diện ngang, trữ lượng, độ cao...). Thực ra việc giải thích như vậy sẽ khó hình dung. Việc thử nghiệm, tập tành và cảm nhận những dữ liệu, biểu đồ tạo ra mới là phương án tốt nhất. Hãy cùng thử nghiệm và cảm nhận các biểu đồ qua sự kết hợp 04 packages nói trên.
  
> g1=ggplot(data=rt2, aes(x=diameter,y=tree_height, color=age))+ theme_minimal()+ xlab("stump diameter, cm")+ ylab("tree height, m")+geom_rangeframe()+ theme_tufte()+scale_x_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$diameter))+scale_y_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$tree_height)) +ggtitle(“Figure 1”)
> gg=g1+geom_point_interactive(aes(tooltip=age, data_id=age), size=2)
> ggiraph(code=print(gg), width=0.7)

#result Figure 1 


> g2=ggplot(data=rt2, aes(x=del_diameter,y=del_tree_height,colour=age))+ theme_minimal()+ xlab("growth stump diameter, cm/year")+ ylab("growth tree height, m/year")+geom_rangeframe()+ theme_tufte()+scale_x_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$del_diameter))+scale_y_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$del_tree_height))+ggtitle("Figure 2")
> gg2=g2+geom_point_interactive(aes(tooltip=age, data_id=age), size=2.5)+ scale_colour_gradient(low="#999999", high="#FF3333")
> ggiraph(code=print(gg2), hover_css="fill-opacity:.3:cursor:pointer:")
#result Figure 2 


> g3=ggplot(data=rt2, aes(x=g,y=m, color=do_cao))+ theme_minimal()+ xlab("G, cm2")+ ylab("M, m3")+geom_rangeframe()+ theme_tufte()+scale_x_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$g))+scale_y_continuous(breaks=extended_range_breaks()(rt2$m))+ggtitle("Figure 3")
> gg=g3+geom_point_interactive(aes(tooltip=do_cao, data_id=do_cao), size=2)
> ggiraph(code=print(gg), hover_css="fill-opacity:.3:cursor:pointer:")
#result Figure 3 


==============================================================================
Tham khảo: http://docs.ggplot2.org

0 comments:

chủ đề

Ăn của rừng bài báo khoa học bản quyền bành trướng Bảo vệ cây là bảo vệ chính mình biến đổi khí hậu Biển Đông Biết sai vẫn cứ làm biểu đồ biểu đồ hộp biểu đồ sai số chuẩn Biểu đồ tương quan Biểu đồ với nhãn bon-sai boxplot buoc-dau-nghien-cuu-khoa-hoc but-ky-doi-toi Cái tài Cái tâm Cái tầm canh tác đất dốc Cây xanh đô thị Cha chung không ai khóc cha nào con nấy Chân thiện mỹ chân trong chân ngoài chạy chức chạy quyền Che chở Chết toàn tập chọn cách ta sống chữ tín chuyện giờ mới kể có vấn đề Cơm áo gạo tiền Con cháu các cụ con người biến thái Con ông cháu cha công nghệ 4.0 correlation matrix corrgram corrplot Cứ đi rồi sẽ tới cuộc cách mạng 4.0 Đam mê đàn gảy tai trâu danh dự danh xưng phù phiếm Đạo đức sống đào tạo sau đại học Đạo văn Đấu tranh sinh tồn day-do Đẹp trong tâm hồn Đi tắt đón đầu dở khóc dở cười đọc nghe nhìn và cảm nhận Dồn điền đổi thửa Động lực dựa vào nhau mà sống error bar plot GGalyy ggcorplot ggExtra ggiraph ggplot2 ggrepel ggthemes Giáng sinh Giáo dục giàu nghèo giục tốc bất đạt Góc quê gridExtra Hài lòng Hai mặt một lời hãy là chính mình hãy sống có trách nhiệm hơn hèn nhát Hiệu sau ứng bão hiệu ứng domino formosa Hiệu ứng sau bão Hòa cả làng học giả bằng thật hoc-lam-tho hoc-r-moi-ngay Ích kỷ KH&CN khả năng Khoán chi Không lối thoát Kiểm định thống kê kỹ năng mềm Kỷ niệm vùng miền Label lan rừng Lão Hạc thế kỷ 21 Liêm chính lính đánh thuê Lợi dụng lợi ích nhóm lừa trên gạt dưới lười suy nghĩ Lương thiện giả vờ Lương y Ma trận tương quan Mẹ Miền cát trắng miền đất hứa Mộc Châu món ăn địa phương Mùa gặt Mục đích sống Mường La Nghịch lý chất lượng - số lượng Nghiên cứu khoa học Ngồi chơi xơi nước Nhân cách nhu cầu Những cung đường tôi đã qua NN&PTNT phân cấp sinh trưởng phân tích hậu định phan-bien-xa-hoi plot3D psych Quán Nha R Rừng ngập mặn rước hổ về nhà rvg sach-hay SARS-CoV-2 sau-luy-tre-lang sciplot Số cây Số liệu trống không Sông Châu sống chết mặc ai sức ỳ sức ỳ bản thân suy thoái Tầm lùn tâm sự tâm sự buồn thảm họa formosa thảm họa môi trường tham nhũng Thân cô thế cô thắng cố ngựa Thăng trầm Thấy vậy mà không phải vậy Thế cây Thế cây cổ Thế cây thế người Thông điệp cuộc đời Thống kê mô tả Thông tư Thước đo lòng người Thủy điện Tiên trách kỷ hậu trách nhân Tình bạn cao đẹp Tình người Tố chất làm khoa học tội đếch gì mà phải ghét ai Tôi sợ giầu lắm track changes Trải nghiệm tre già măng mọc trở mặt Trung thực tư duy Tự sự Tư tưởng thụt lùi tuy duy nhiệm kỳ Ứng dụng R trong lâm nghiệp Văn hóa cảm ơn Văn hóa giao thông văn hóa ngầm Văn hóa xin lỗi Xấu khen đẹp chê Xỏ nhầm giầy xoay đầu đổi đít Ý tưởng

bài đã đăng

Powered by Blogger.

Disqus Shortname

Widget Recent Post No.

Widget Random Post No.

Widget Recent Comment No.

PageNavi Results No.

Labels Max-Results No.

Comments system

Contact Form

Name

Email *

Message *

bài đăng phổ biến

số lượt ghé qua trang blog

Bài đăng nổi bật

Thế cây thế người

T hế trong CÂY CẢNH thể hiện các chi tiết về CẤU TRÚC ở mọi phương diện, đa góc nhìn (trên dưới trái phải ngang dọc), trong đ...

Bài đăng phổ biến

bài xem nhiều nhất